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1997年，以国家科技部牵头，由卫生部、国家食品监督管理局、国家中医药管理局等部门参加，成立了国家新药领导小组，组织全国百余名专家提出了现代化发展的规划，启动实施了现代化工作。全国的中医药现代化工作已经取得了重要进展:研发体系不断完善，自主创新能力显著增强;成功地开发出一批新品种，防治疾病的重要作用得以进一步发挥;制定了一批重要的基础标准和符合特点的科学规范，产业标准规范建设初见成效。同时，现代化在提高人民健康水平、增加农民收入、保护生态环境等方面也发挥了显著作用。2005年4月前，内地已建立了448个材规范化种植基地，18个省份规范化种植面积达92万公顷。同时，随着超临界萃取、膜分离、沸腾造粒等生产技术和工艺的突破，生产工艺技术、装备水平大幅提高，企业规模、效益也不断提升。涵盖农业、工业、商业的现代产业链不断完善和发展。
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